ارزیابی استراتژیک زیست محیطی ابزاری ارزشمند برای ادغام ملاحظات زیست محیطی در سیاست‌گذاری است. اما با چالش‌های متعددی مواجه می باشد. رفع این ایرادات مستلزم تغییرات ساختاری، بهبود روش‌شناسی، افزایش مشارکت ذینفعان، و تقویت ظرفیت‌های فنی و سازمانی است. با اجرای راهکارهای پیشنهادی، می‌توان اثربخشی SEA را به طور قابل توجهی افزایش داد و به تصمیم‌گیری پایدارتر در سطح استراتژیک دست یافت. پیشنهاد یک مدل جایگزین برای ارزیابی استراتژیک محیط زیست (SEA) که بتواند ایرادات آن را برطرف کند و پاسخگوی طیف وسیع‌تری از نیازها باشد، ایده‌ی جالبی است. بر اساس چالش‌هایی که در نوشتار حاضر مطرح کردیم، می‌توان یک مدل جدید را پیشنهاد داد که "ارزیابی یکپارچه پایداری سیستمی " (Integrated System Sustainability Assessment - ISSA) نام دارد. در این نوشتار نگارنده سعی دارد برای هر چالش نامبرده شده، راهکارهای انجام پذیری ارائه دهد تا قابلیتها و توانایی مدل پیشنهادی بیشتر و واقع بینانه تر باشد.